El Consejo General de Guerra, quien investigó la responsabilidad de ocho oficiales de alto rango de la Armada, por el hundimiento del submarino ARA San Juan, destituyó al capitán Villamide y dispuso el arresto del ex jefe de la Armada, Marcelo Srur.

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Marcelo Srur fue sancionado con arresto riguroso, por haber informado en forma incompleta al Ministerio de Defensa, de los sucesos acontecidos con el submarino ARA San Juan, "impidiendo de esta forma también proporcionar información a los familiares de los tripulantes, con el agravante de no comparecer ante la opinión pública demostrando falta de compromiso y diligencia", palabras difundidas por el Ministerio de Defensa. 

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El contraalmirante Luis Enrique López Mazzeo fue sancionado con 60 días de arresto riguroso en virtud del procesamiento que rige en su contra en la causa penal.

El capitán del navío Claudio Javier Villamide fue destituido, al ser considerado "negligente en su accionar al evidenciar falta de cuidado o descuido de la tropa y equipamiento a su cargo, al no haber ordenado ni recomendado expresamente al Comandante del ARA San Juan al conveniencia de permanecer en superficie por un período limitado", según informaron fuentes cercanas.